病菌主要来源于土壤、作物的病残体、枯枝黄叶、杂草等。为了减少、控制病虫害的发生危害，提高设施农业产量，各乡镇应及时做好大棚消毒工作。
1、轮作倒茬，合理安排茬口，尽量避免连茬种植同一种类的蔬菜、瓜类。
2、搞好棚内周围的清洁，及时清除病虫危害的枯枝黄叶、残枝败叶，铲除周围杂草，减少病虫来源。
3、利用太阳能进行土壤热力消毒。利用夏季高温对土壤进行翻晒消毒，杀死病虫。用棚膜若闭棚高温消毒，效果更好。
4、棚内土壤用石灰消毒。每亩用10—15公斤石灰撒施后翻地，有利于杀灭病菌。
5、播种前对苗床土一定要用药剂进行消毒。具体方法是：播种及分苗前，苗床土壤消毒用50%多菌灵可湿粉剂按每平方米用药8—10克与15—30公斤细土混合，取三分之一撒在床面做垫土，三分之二用于播种后作为覆土使用，覆土后用塑料膜盖严，保持苗床湿润，防止药害发生。大田移栽前，土壤消毒用50%敌克松可湿粉剂按每亩用药2公斤撒施于土表，再进行深翻后移栽。除以上药剂外，也可用重茬王杀菌剂按一个标准苗床（10平方米）用药40—50克兑水后均匀喷洒苗床。棚内移栽前，每亩用高效土壤菌虫速杀1—1.2公斤拌细土后均匀撒在地表面，深翻整地即可。
