(2)轮作倒茬 西瓜枯萎病菌寄生专化性强，可与非寄主作物如黄瓜、丝瓜及其他非瓜类蔬菜实行4年以上轮作。避免连茬种植。
(3)药剂灌根 定植缓苗前或零星病株发病初期，可用5%菌毒清水剂800倍液.或45%特克多悬浮剂1000倍液.或10%双效灵水剂250倍液.或50%复方硫菌灵可湿性粉剂500倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或2%抗菌霉素(农杭120) 200倍液灌根.每株药液量0.25千克，视病情连续防治2-3次.
(1)嫁接换根 温室西瓜栽培集约化程度高，可用瓠瓜等作砧木，西瓜良种作接穗进行嫁接.是防病增产的有效途径。
