印尼是第二大可可生产地，对可可的需求增大推动农民扩大可可的种植面积，2012年面积扩大了近50%。可可种植户需要投入大量的资本，来提高可可的单位面积产量，以求与非洲西部国家持平。每公顷总投入的15%用于农药，其余大部分用于土地和肥料。农业投入日益加大，90%的生产者是小型生产者，但正是他们创造了近年来可可产量增长量的40%，高产实现更多的利润促进了更多的小生产者对可可的种植，并加大种植的面积。
可可种植中，最严重病害是可可豆荚打孔虫及维管条纹性枯死病，过去二者摧毁的可可面积总计高达7万公顷，并能降低其他区域一半的产量，由此可看出运用植保技术的重要性。
另外，受棕榈油价格的增长，和全球对食用油需求的增大，棕榈产量在2013年预计有望实现同比增长率25%。在大面积的棕榈种植中，各种投入主要购买自合作社或者直接买自分销商。约25%为小型生产户，产量略低于潜在的每公顷8吨棕榈粗油，而在邻国马来西亚却能达到这样的产量。约15%的棕榈种植归国有，积极的运作和内在的需求增强将在很大程度上支撑作物生产投入的增加。
甘蔗和大豆也处于增长态势。橡胶，玉米和特色作物包括辣椒、马铃薯和青葱是该国的主要作物，当然，水稻和玉米仍然是农民的关键作物，对国家的食品安全也至关重要。
